Pendant la guerre civile Francisco Samper Frenollar avait été un des conseillers CNT de la mairie d’Almeria (août 1937).

En janvier 1944 Francisco Samper était membre du Comité provincial de la CNT à Almeria. Il représentait également, avec Carretero, la CNT au Comité régional andalou de l’Alliance Nationale des Forces Démocratiques (AFND). Il a été arrêté à Alméria dans les premiers mois de 1944 avec pratiquement tout le comité provincial de la CNT dont le secrétaire José Rovira, Carretero et Cristobal Doblas le secrétaire de défense. Au cours de cette vague d’arrestations qui avait touché également le parti socialiste, le parti communiste et les républicains, ce sont plus de 150 personnes qui furent détenues à Alméria.