Manuel Navarro Peinado fit partie du groupe de 32 militants de la CNT et des Jeunesses libertaires (FIJL) accusés d’avoir diffusé à Valence en 1940 le manifeste « A todos los Españoles » appelant à la neutralité de l’Espagne pendant le conflit mondial et qui avait été rédigé en France par Francisco Ponzan Vidal. Accusés de « haute trahison et espionnage », ils furent traduits devant un conseil de guerré réuni à Valence le 7 novembre 1941. Manuel Navarro Peinado, comme 7 autres des accusés fut condamné à 30 ans de prison. Dix condamnations à mort avaient été prononcées et trois d’entre elles – Angel Tarin Haro, Enrique Goig Lostado et Enrique Escobedo Vaello – seront exécutées le 19 novembre suivant.

Manuel Navarro Peinado est mort de tuberculose à la prison de Cuellar.