Juan Gonzalez Morales a été traduit devant un conseil de guerre qui s’est réunit à Cadix en décembre 1945 contre 28 antifranquistes dont 19 militants de la CNT : Sebastian Pino Panal, José Fernandez Rodriguez, Joaquin Serrano Duarte, José Marfil Ruiz, José Mélendez Aldana, Domingo Hormigo Sanchez, Francisco Cuaro Vicario, Adela Ruiz Guerrero, Tomas Pizarro Benitez, José Maria Bermejo Gomez, Diego Pérez Ruiz, José Lillo Pérez, Julio Quintera Talavera, Luis Quiros Ortega, Juan Corral Sanchez, Angel Gonzalez Gonzalez, Juan Gomez Jiménez et Andrés Rojas Cuenca.

Juan Gonzalez Morales a été condamné à mort avec 17 autres des accusés ; puis toutes les peines de mort furent commuées en peine de 30 ans de détention.