En juillet 1936, lorsqu’il se rendit compte que les franquistes allaient l’emporter à Saragosse, Francisco Alcubierre Viamonte avait pris la tête d’un petit groupe de compagnons mal armés qui décidaient de rejoindre la zone républicaine. Après avoir traversé le rio Gallego et les sierras de Risglou, Gratal et Caballera, le groupe parvenait enfin en zone loyale. Francisco Alcubierre s’intègrait alors aux milices confédérales qui de Barbastro et de Barcelone se dirigaient vers Huesca. Il avait été nommé chef de groupe (vingt hommes) d’une centurie de la Colonne Roja Y Negra. Lors de la militarisation des colonnes il avait le grade de lieutenant à la 127° Brigade (ex Roja y Negra) de la 28° Division.
Commandant d’une compagnie, il a été fait prisonnier à la fin de la guerre et emprisonné pendant quatre années. Francisco Alcubierre Viamonte est mort en 1943 à Uncastillo (Saragosse), peu après sa libération.
Son frère Agustin Alcubierre Viamonte avait été assassiné par les franquistes en 1936.