Militant des jeunesses libertaires (FIJL) d’Almeria, Juan del Aguila Aguilera avait été emprisonné en 1934 avec son frère Francisco et A. Vargas. Après le coup d’état franquiste de juillet 1936, il représenta la FAI au comité central antifasciste d’Almeria puis jusqu’en 1937 au Comité permanent du front Populaire. Il a été également président du Comité pro-presos (au moins jusqu’en janvier 1937) puis inspecteur à la Commission de Vigilance.
Juan del Aguila Aguilera a été fusillé le 6 mars 1941 à Almeria aux cotés de ses frères Francisco et Rafael.