Juan Ignacio fut arrété en mars 1947 lors des rafles qui touchèrent le mouvement libertaire en Aragon, Rioja et Navarre et dans lesquelles furent, entre autres, détenus les militants anarchistes Emilio Andrés, Cebrian, José Pastor, Luis Mainar, Luis Moranda, Antonio Palacios, Francisco Sanclemente, Azais, Francisco Saro et José Joménez.